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AI 靶点发现模型:从相关信号到因果假设的证据梯度

AI 靶点发现不是从数据里直接“算出靶点”,而是把遗传、组学、网络、文献和可成药性证据组合成可验证假设。

AI 靶点发现处在药物研发最上游,也是最容易被夸大的环节。模型能帮助排序和发现线索,但靶点是否真正驱动疾病,必须由因果证据和实验验证支撑。

证据梯度

  • 遗传证据:GWAS、罕见变异、Mendelian randomization 通常比差异表达更接近因果。
  • 组学证据:转录组、蛋白组、单细胞、空间组学可提示疾病状态,但常是相关信号。
  • 网络和文本证据:帮助汇总已有知识,也可能放大研究热度偏差。
  • 可成药性:有疾病因果也不代表能做药,还要看口袋、E3 可招募性、组织表达和安全窗。

项目判断

  • 把 AI 输出写成“候选靶点假设”,不要写成靶点已被证明。
  • 优先设计能推翻假设的实验:敲降/敲除、救援实验、疾病模型、选择性药理工具。
  • 分子胶项目还要问:靶点是否能被诱导邻近、是否有可利用 degron/表面、是否适合目标组织。

关键要点

  • 靶点发现要区分相关、因果和可成药性;
  • AI 排序只能生成假设,不能替代生物学验证;
  • 分子胶项目还需考虑 E3、表面、组织表达和安全窗。

延伸资源

  • 配套:152《PandaOmics》;数据资源:Open Targets、DepMap、GWAS Catalog。