BindingDB 是聚焦实测结合亲和力的公共数据库,收录大量蛋白-配体的 Ki、Kd、IC50 等定量结合数据。
有什么数据
- 蛋白-配体结合亲和力(Ki/Kd/IC50)
- 靶点与配体结构信息
- 实验来源与条件
- 与 PDB、UniProt 的交叉链接
怎么获取与使用
网页检索与批量下载,也可经 API 获取;常被整理成 DTI/亲和力预测的训练集(如 Davis、KIBA 部分来源)。
使用提示
同一对象的不同实验值需谨慎合并;与 ChEMBL 有重叠但侧重结合亲和力,适合 DTI/DTA 建模(见 157)。
延伸资源
- 对照 226《ChEMBL》;DTI 见 246、157。