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ADMET 是什么:AI 药物发现必须跨过的成药性门槛

ADMET 指吸收、分布、代谢、排泄与毒性——大多数候选分子不是死于活性不够,而是死于成药性。这篇给出各终点的具体判据、参数间的相互制约与 AI 的实际作用位置。

ADMET 是 Absorption(吸收)、Distribution(分布)、Metabolism(代谢)、Excretion(排泄)、Toxicity(毒性)的首字母。它描述一个分子进入体内之后「会经历什么」——也就是成药性的核心

为什么 ADMET 决定成败

  • 历史上大量候选药不是死于活性不够,而是死于 ADMET:吸收差、代谢太快、有毒性。虽然近几十年因 ADMET 导致的失败比例已显著下降(正是因为早期评估成为常规),但它仍是先导优化的主要约束。
  • 越晚发现代价越高:先导阶段发现代谢问题,改结构即可;临床阶段发现,损失是数千万美元与数年时间。
  • ADMET 是多目标博弈提升一个性质常常牺牲另一个——这是它真正困难的地方(见下)。

各终点的具体判据

终点 常用体外测定 大致可接受范围
溶解度 动力学/平衡溶解度 > 50 μM(口服)
通透性 Caco-2 / MDCK / PAMPA Papp > 5×10⁻⁶ cm/s
外排比 Caco-2 双向 < 2~3
代谢稳定性 肝微粒体/肝细胞 CLint 人 CLint < 20 μL/min/mg
血浆蛋白结合 平衡透析 fu > 0.01(过高结合难优化)
hERG 膜片钳 IC₅₀ > 10 μM 或安全边际 > 30 倍
CYP 抑制 五大亚型面板 IC₅₀ > 10 μM
遗传毒性 Ames、微核 阴性
细胞毒性 多细胞系 相对靶点活性有窗口

这些数字是通用参考,实际标准应从 TPP 反推(见 414《目标产品特征 TPP》):每日一次口服的慢性用药,要求远严于急性期静脉给药。

参数间的核心制约

# 最重要的一条:logP 几乎与所有 ADMET 终点相关
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#   logP ↑ →  通透性 ↑(好)
#             活性 ↑(通常,疏水结合)
#             溶解度 ↓(坏)
#             代谢清除 ↑(坏,CYP 偏好脂溶性底物)
#             hERG 风险 ↑(坏)
#             血浆蛋白结合 ↑(游离浓度 ↓)
#             非特异性毒性 ↑(坏)
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# → logP 是最有杠杆效应的单一参数
#   控制住它(通常 1~3.5),很多下游问题会同时改善

# 第二条:分子量
#   MW ↑ → 活性 ↑(更多接触点)
#           通透性 ↓、溶解度 ↓、口服吸收 ↓
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# 第三条:氢键供体(HBD)
#   HBD ↑ → 溶解度 ↑
#            通透性 ↓(去溶剂化代价高)
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# 这就是为什么类药规则会关注这几个参数(见 064)

理解这些制约关系,比记住任何单一阈值都重要:它让你知道「改这里会同时影响哪些地方」。

ADME 级联筛选

# 实际项目中按成本与通量分级安排(见 082)
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# 第 1 级(计算,秒级,每个分子)
#   cLogP、TPSA、MW、HBD/HBA、结构警报
#   QSAR 预测:溶解度、hERG、CYP、代谢稳定性
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# 第 2 级(高通量体外,数百个分子)
#   动力学溶解度、PAMPA、微粒体稳定性、hERG 结合
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# 第 3 级(中通量,数十个分子)
#   平衡溶解度、Caco-2、肝细胞稳定性、
#   血浆蛋白结合、CYP 抑制面板
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# 第 4 级(低通量,少数分子)
#   hERG 膜片钳、代谢产物鉴定、
#   动物 PK、遗传毒性
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# 关键原则:
#   越便宜的筛越早做,用于排除明显不行的
#   计算预测的作用是「第 0 级」——在合成前就过滤

AI 在 ADMET 中的实际作用位置

  • 合成前预测:这是最有价值的位置。在决定做哪些分子之前,用模型排除高风险的(见 350《在分子生成中加入 ADMET 约束》);
  • 体外单机制终点预测较可靠:hERG、CYP 抑制、Ames、溶解度——数据量大、机制单一,AUROC 常能到 0.85 以上(见 244《TDC ADMET Group》);
  • 体内综合参数预测能力有限:半衰期、清除率、生物利用度受多因素共同决定,Spearman 到 0.4~0.5 已算不错;
  • 不替代实验:预测用于排序与优先级,关键结论仍需体外/体内验证。模型提示高风险的分子应优先安排实测确认,而非直接淘汰(见 417《计算与实验的差距》);
  • 多任务学习有帮助:ADMET 各终点间有相关性,数据少的终点能从数据多的终点借力(见 334《训练 ADMET 多任务模型》)。

常见的认知误区

  • 把 ADMET 当作后置检查最常见也最致命。先把活性优化到极致,再回头处理 ADMET——此时分子往往已经又大又油,无从下手。活性与性质必须并行优化。
  • 盲信类药规则:Lipinski 规则是统计概括不是物理定律,大量成功药物违反它(见 064《Lipinski 五规则》);
  • 只看单点数据:溶解度、代谢稳定性等受测定条件影响大,跨实验室的数据不可直接比较;
  • 忽略游离浓度:血浆蛋白结合率不同的化合物,总浓度不可比(见 062《血浆蛋白结合率 PPB》);
  • 把预测当实测:决策表中必须清楚区分。

关键要点

  • ADMET 是多目标博弈,logP 是杠杆效应最大的单一参数
  • 活性与性质必须并行优化,把 ADMET 当后置检查是常见的致命错误;
  • AI 在体外单机制终点上预测较可靠,体内综合参数能力有限;
  • 预测用于排序与优先级,不替代实验验证。

延伸资源