ADMET 是 Absorption(吸收)、Distribution(分布)、Metabolism(代谢)、Excretion(排泄)、Toxicity(毒性)的首字母。它描述一个分子进入体内之后「会经历什么」——也就是成药性的核心。
为什么 ADMET 决定成败
- 历史上大量候选药不是死于活性不够,而是死于 ADMET:吸收差、代谢太快、有毒性。虽然近几十年因 ADMET 导致的失败比例已显著下降(正是因为早期评估成为常规),但它仍是先导优化的主要约束。
- 越晚发现代价越高:先导阶段发现代谢问题,改结构即可;临床阶段发现,损失是数千万美元与数年时间。
- ADMET 是多目标博弈:提升一个性质常常牺牲另一个——这是它真正困难的地方(见下)。
各终点的具体判据
| 终点 | 常用体外测定 | 大致可接受范围 |
|---|---|---|
| 溶解度 | 动力学/平衡溶解度 | > 50 μM(口服) |
| 通透性 | Caco-2 / MDCK / PAMPA | Papp > 5×10⁻⁶ cm/s |
| 外排比 | Caco-2 双向 | < 2~3 |
| 代谢稳定性 | 肝微粒体/肝细胞 CLint | 人 CLint < 20 μL/min/mg |
| 血浆蛋白结合 | 平衡透析 | fu > 0.01(过高结合难优化) |
| hERG | 膜片钳 | IC₅₀ > 10 μM 或安全边际 > 30 倍 |
| CYP 抑制 | 五大亚型面板 | IC₅₀ > 10 μM |
| 遗传毒性 | Ames、微核 | 阴性 |
| 细胞毒性 | 多细胞系 | 相对靶点活性有窗口 |
这些数字是通用参考,实际标准应从 TPP 反推(见 414《目标产品特征 TPP》):每日一次口服的慢性用药,要求远严于急性期静脉给药。
参数间的核心制约
# 最重要的一条:logP 几乎与所有 ADMET 终点相关
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# logP ↑ → 通透性 ↑(好)
# 活性 ↑(通常,疏水结合)
# 溶解度 ↓(坏)
# 代谢清除 ↑(坏,CYP 偏好脂溶性底物)
# hERG 风险 ↑(坏)
# 血浆蛋白结合 ↑(游离浓度 ↓)
# 非特异性毒性 ↑(坏)
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# → logP 是最有杠杆效应的单一参数
# 控制住它(通常 1~3.5),很多下游问题会同时改善
# 第二条:分子量
# MW ↑ → 活性 ↑(更多接触点)
# 通透性 ↓、溶解度 ↓、口服吸收 ↓
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# 第三条:氢键供体(HBD)
# HBD ↑ → 溶解度 ↑
# 通透性 ↓(去溶剂化代价高)
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# 这就是为什么类药规则会关注这几个参数(见 064)
理解这些制约关系,比记住任何单一阈值都重要:它让你知道「改这里会同时影响哪些地方」。
ADME 级联筛选
# 实际项目中按成本与通量分级安排(见 082)
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# 第 1 级(计算,秒级,每个分子)
# cLogP、TPSA、MW、HBD/HBA、结构警报
# QSAR 预测:溶解度、hERG、CYP、代谢稳定性
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# 第 2 级(高通量体外,数百个分子)
# 动力学溶解度、PAMPA、微粒体稳定性、hERG 结合
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# 第 3 级(中通量,数十个分子)
# 平衡溶解度、Caco-2、肝细胞稳定性、
# 血浆蛋白结合、CYP 抑制面板
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# 第 4 级(低通量,少数分子)
# hERG 膜片钳、代谢产物鉴定、
# 动物 PK、遗传毒性
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# 关键原则:
# 越便宜的筛越早做,用于排除明显不行的
# 计算预测的作用是「第 0 级」——在合成前就过滤
AI 在 ADMET 中的实际作用位置
- 合成前预测:这是最有价值的位置。在决定做哪些分子之前,用模型排除高风险的(见 350《在分子生成中加入 ADMET 约束》);
- 体外单机制终点预测较可靠:hERG、CYP 抑制、Ames、溶解度——数据量大、机制单一,AUROC 常能到 0.85 以上(见 244《TDC ADMET Group》);
- 体内综合参数预测能力有限:半衰期、清除率、生物利用度受多因素共同决定,Spearman 到 0.4~0.5 已算不错;
- 不替代实验:预测用于排序与优先级,关键结论仍需体外/体内验证。模型提示高风险的分子应优先安排实测确认,而非直接淘汰(见 417《计算与实验的差距》);
- 多任务学习有帮助:ADMET 各终点间有相关性,数据少的终点能从数据多的终点借力(见 334《训练 ADMET 多任务模型》)。
常见的认知误区
- 把 ADMET 当作后置检查:最常见也最致命。先把活性优化到极致,再回头处理 ADMET——此时分子往往已经又大又油,无从下手。活性与性质必须并行优化。
- 盲信类药规则:Lipinski 规则是统计概括不是物理定律,大量成功药物违反它(见 064《Lipinski 五规则》);
- 只看单点数据:溶解度、代谢稳定性等受测定条件影响大,跨实验室的数据不可直接比较;
- 忽略游离浓度:血浆蛋白结合率不同的化合物,总浓度不可比(见 062《血浆蛋白结合率 PPB》);
- 把预测当实测:决策表中必须清楚区分。
关键要点
- ADMET 是多目标博弈,logP 是杠杆效应最大的单一参数;
- 活性与性质必须并行优化,把 ADMET 当后置检查是常见的致命错误;
- AI 在体外单机制终点上预测较可靠,体内综合参数能力有限;
- 预测用于排序与优先级,不替代实验验证。
延伸资源
- 本模块后续逐项展开各终点;数据与建模:244《TDC ADMET Group》、334《训练 ADMET 多任务模型》;
- 类药规则:064《Lipinski 五规则》、065《Veber Rule》;效率指标:071《配体效率 Ligand Efficiency》、072《脂溶性配体效率 LLE》。