需要复合物结构、又要本地批量时，用开放权重的 Boltz 或 Chai-1。
操作步骤
- 按官方仓库部署（需 GPU）；
- 准备输入：目标蛋白序列 + 配体（SMILES）/伙伴链；
- 运行预测，得到复合物结构与置信度；
- 用置信度筛掉不可靠区域；
- 进入对接/相互作用分析或设计。
常见坑与提示
置信度解读同结构预测；配体/复合物精度仍有限，关键结论需实验或正交方法验证；本地部署的最大好处是无配额、可批量。
延伸资源
- 工具见 192、193；报告见 120–122。
用 Boltz 或 Chai-1 预测蛋白-配体复合物
用开放的 Boltz / Chai-1 在本地预测蛋白-配体（及多组分）复合物结构，不受网页配额限制。