用 Meeko 准备 Docking 文件：PDBQT 文件怎么生成

对接前要把分子转成 PDBQT 格式。Meeko 是 Vina 生态的标准准备工具。

操作步骤

1. pip install meeko；
2. 配体：用 mk_prepare_ligand.py 生成 PDBQT（自动处理可旋转键）；
3. 大环：启用 Meeko 的大环处理选项；
4. 受体：准备受体 PDBQT；
5. 把生成的文件喂给 Vina（见 336）。

延伸资源

• 概念见 106；工具见 214；下一步 336。