PLIP 能自动识别复合物中的各类相互作用并出报告，适合快速核对姿势。
操作步骤
- 准备复合物结构（受体 + 配体姿势）；
- 用 PLIP 网页版或
pip install plip命令行分析； - 查看识别出的氢键、疏水、π 堆积、盐桥与涉及残基；
- 核对是否命中已知关键相互作用；
- 对比不同分子的相互作用差异辅助 SAR。
常见坑与提示
PLIP 偏「出报告」，ProLIF 偏「出可分析指纹」，二者配合用；报告依赖正确的结构准备与质子化。
延伸资源
- 概念见 108；工具见 208；对照 338。
用 PLIP 生成蛋白-配体相互作用报告
用 PLIP 一键生成相互作用报告，快速核对对接姿势是否形成了预期的关键相互作用。