用 对接打分作为生成约束,引导分子结合目标口袋;但这是最容易被钻空子的组件。
操作步骤
- 准备好受体口袋与对接流程(见 336);
- 在生成循环里对候选分子做快速对接打分;
- 把对接分作为奖励组件(注意计算成本);
- 限制分子大小/脂溶性,防止「靠变大刷分」;
- 对高分结果用更可信方法(GNINA/MM-GBSA)复核。
常见坑与提示
对接打分极易被 reward hacking(生成又大又脏的分子刷高分);务必配合 LE/LLE、SA、ADMET 约束,并对结果重打分复核(见 071、337)。
延伸资源
- 概念见 095;对接见 336、337。