连接子设计出现在片段连接与双功能分子(如 PROTAC)里:把两个结合单元连起来。
操作步骤
- 确定两个锚定基团的空间位置与出口向量;
- 枚举/生成满足几何约束的连接子(长度、角度);
- 用对接/构象检查连接后是否仍能同时结合;
- 评估连接子带来的柔性、性质与可合成性变化;
- 对 PROTAC 还要看三元复合物可行性(见 359、360)。
常见坑与提示
连接子不是「随便连上即可」:长度/刚性显著影响活性与成药性;PROTAC 的 linker 直接决定降解效率,需专门优化。
延伸资源
- 概念见 054《片段》;模态见 360《PROTAC Linker》。