骨架跃迁用于改善性质、规避专利或突破优化瓶颈:换母核但保住关键相互作用。
操作步骤
- 明确要保留的关键药效团/相互作用(见 092);
- 方法一:形状/药效团相似性搜索(ROCS 类,见 278)找新骨架;
- 方法二:核心替换工具(ReCore,见 306)保留出口向量换中心;
- 方法三:生成模型做骨架装饰/约束生成;
- 对候选用对接 + 相互作用核对验证是否保住关键作用。
常见坑与提示
跃迁后务必验证关键相互作用与活性是否保住;新骨架的 ADMET/可合成性要重新评估,别只看相似度。
延伸资源
- 概念见 040;工具见 278、306。