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PyMOL 开源版:结构可视化和作图流程

PyMOL 开源版满足多数结构可视化与作图需求,掌握选择语法与渲染即可出版级配图。

PyMOL(开源版)是结构可视化与作图的主力工具,开源版即可满足多数需求。

安装与部署

conda install -c conda-forge pymol-open-source

典型用法

  • 展示口袋、配体与关键相互作用
  • 画卡通/表面/棍状组合表示
  • 脚本化(.pml/Python)保证可复现
  • 光线追踪渲染出版级图

上手提示

先掌握选择语法与几种表示方式,再学渲染;用脚本固化作图流程,保证图可复现。

延伸资源

  • 概念见 110;网页端见 212、213。