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ProLIF:蛋白-配体相互作用指纹工具

ProLIF 把相互作用编码成可分析的指纹,适合比较姿势、统计 MD 轨迹中相互作用的稳定性。

ProLIF 把蛋白-配体相互作用编码成相互作用指纹,便于量化比较与轨迹统计。

安装与部署

pip install prolif

典型用法

  • 对接姿势的相互作用指纹比对
  • 统计 MD 轨迹中相互作用频率
  • 生成相互作用特征供建模
  • 与 MDAnalysis 配合分析轨迹

上手提示

用于把「相互作用」变成可计算的向量;对接后核对关键相互作用、MD 后看稳定性都很有用。

延伸资源

  • 概念见 109;对照 208《PLIP》。