ProLIF 把蛋白-配体相互作用编码成相互作用指纹,便于量化比较与轨迹统计。
安装与部署
pip install prolif。
典型用法
- 对接姿势的相互作用指纹比对
- 统计 MD 轨迹中相互作用频率
- 生成相互作用特征供建模
- 与 MDAnalysis 配合分析轨迹
上手提示
用于把「相互作用」变成可计算的向量;对接后核对关键相互作用、MD 后看稳定性都很有用。
延伸资源
- 概念见 109;对照 208《PLIP》。
ProLIF 把相互作用编码成可分析的指纹,适合比较姿势、统计 MD 轨迹中相互作用的稳定性。
ProLIF 把蛋白-配体相互作用编码成相互作用指纹,便于量化比较与轨迹统计。
pip install prolif。
上手提示
用于把「相互作用」变成可计算的向量;对接后核对关键相互作用、MD 后看稳定性都很有用。