OpenBabel 是化学文件格式转换工具，支持 PDB/SDF/MOL2/PDBQT/SMILES 等上百种格式。
安装与部署
conda install -c conda-forge openbabel，命令行与 Python（pybel）均可。
典型用法
- 在各种化学格式间互转
- 加氢、由 2D 生成 3D
- 批量处理结构文件
- 为对接准备中间格式
上手提示
转换非无损（键级/电荷/立体可能误判），转换后用 RDKit 核查关键结构。
延伸资源
- 概念见 107；工具栈见 218《Datamol》。