Meeko 为 AutoDock Vina 准备配体/受体的 PDBQT 文件，处理原子类型、可旋转键与大环。
安装与部署
pip install meeko。
典型用法
- 生成配体/受体 PDBQT
- 处理大环柔性对接
- 与 Vina 1.2 Python 接口配合
- 批量准备对接输入
上手提示
对接结果质量很大程度取决于准备；流程：PDBFixer 修结构 → Meeko 准备 → Vina 对接。
延伸资源
- 概念见 106；对接见 182《AutoDock Vina》。
Meeko：Docking 文件准备工具
Meeko 把配体/受体转成 Vina 所需 PDBQT 并处理大环等细节，是 Vina 对接的标准前处理。