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PROTAC Linker 设计:连接子如何影响降解效率

PROTAC 的连接子长度、刚性与连接点强烈影响三元复合物形成与降解效率,是「连接子学(linkerology)」的核心。

PROTAC 的两端配体之间靠连接子(linker)相连。看似不起眼,linker 却常常决定降解成败。

linker 影响什么

  • 长度/柔性决定能否形成 productive 三元构象
  • 连接点(exit vector)影响几何
  • 组成影响溶解度、通透与代谢
  • 微小改动可显著改变 DC50/Dmax

设计要点

  • 系统扫描长度与刚性(linkerology)
  • 用三元复合物建模辅助筛选
  • 兼顾降解活性与成药性
  • 与连接子设计的计算方法相通(见 354)

关键要点

linker 不是「随便连」:它直接调控三元复合物,是 PROTAC 优化最关键也最经验性的环节。

延伸资源

  • 对照 359《三元复合物》、354《Linker Design》。