DiffDock 是基于扩散模型的盲对接工具,无需指定口袋即可生成结合姿势。
安装与部署
按官方仓库配置环境(需 GPU 与若干依赖),用示例蛋白-配体跑通推理。
典型用法
- 对无明确口袋的靶点做盲对接
- 快速生成候选姿势并按置信度排序
- 与传统对接交叉验证
- 大规模初筛的姿势生成
上手提示
置信度低的结果要谨慎;对训练分布外蛋白可能不稳,建议与 Vina/GNINA 交叉对比。
延伸资源
- 论文见 101;教程见 018。
DiffDock 用扩散模型做盲对接,部署后可快速给出候选姿势与置信度,适合初筛。
DiffDock 是基于扩散模型的盲对接工具,无需指定口袋即可生成结合姿势。
按官方仓库配置环境(需 GPU 与若干依赖),用示例蛋白-配体跑通推理。
上手提示
置信度低的结果要谨慎;对训练分布外蛋白可能不稳,建议与 Vina/GNINA 交叉对比。