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DiffDock:深度学习对接模型部署与使用

DiffDock 用扩散模型做盲对接,部署后可快速给出候选姿势与置信度,适合初筛。

DiffDock 是基于扩散模型的盲对接工具,无需指定口袋即可生成结合姿势。

安装与部署

按官方仓库配置环境(需 GPU 与若干依赖),用示例蛋白-配体跑通推理。

典型用法

  • 对无明确口袋的靶点做盲对接
  • 快速生成候选姿势并按置信度排序
  • 与传统对接交叉验证
  • 大规模初筛的姿势生成

上手提示

置信度低的结果要谨慎;对训练分布外蛋白可能不稳,建议与 Vina/GNINA 交叉对比。

延伸资源

  • 论文见 101;教程见 018。