OpenMM 是高性能、Python 友好的开源 MD 引擎，支持 GPU。
安装与部署
conda install -c conda-forge openmm；验证 GPU 平台可用。
典型用法
- 搭建溶剂化蛋白-配体体系
- 能量最小化、平衡与生产模拟
- 导出轨迹供分析
- 为自由能计算提供采样
上手提示
跑通「最小化→平衡→生产→分析」最小闭环最重要；配体力场（OpenFF）质量是常见坑。
延伸资源
- 教程见 015、128；分析见 205。
OpenMM：分子动力学模拟开源引擎
OpenMM 是 GPU 加速、Python 友好的 MD 引擎，是跑蛋白-配体模拟的推荐起点。