Biopython 是生物信息学的基础 Python 库,覆盖序列、结构、数据库等。
安装与部署
pip install biopython。
典型用法
- 解析 FASTA/GenBank 等序列格式
- 用 PDB 模块处理结构文件
- 做序列比对与基本分析
- 与 NCBI 等数据库交互
上手提示
是生物数据处理的「瑞士军刀」;结构方面常与 RDKit/PDBFixer 配合用于前处理。
延伸资源
- 结构修复见 215《PDBFixer》;序列模型见 194《ESM》。
Biopython 是处理生物序列与结构数据的基础库,常用于序列解析、PDB 处理与数据库交互。
Biopython 是生物信息学的基础 Python 库,覆盖序列、结构、数据库等。
pip install biopython。
上手提示
是生物数据处理的「瑞士军刀」;结构方面常与 RDKit/PDBFixer 配合用于前处理。