OpenFE(Open Free Energy)提供标准化、可复现的 RBFE 自由能计算工作流。
安装与部署
按官方文档用 conda 安装;基于 OpenMM、OpenFF 生态。
典型用法
- 对一系列改造分子做 RBFE 排序
- 搭建可复现的自由能管线
- 指导先导优化的合成优先级
- 作为商业 FEP+ 的开源替代
上手提示
用于关键决策点的少量分子精算,而非海量初筛;需要可靠结合姿势与参数化作前提。
延伸资源
- 概念见 127、130;力场见 202《OpenFF》。
OpenFE 提供可复现的相对结合自由能(RBFE)工作流,是先导优化中自由能计算的开源选择。
OpenFE(Open Free Energy)提供标准化、可复现的 RBFE 自由能计算工作流。
按官方文档用 conda 安装;基于 OpenMM、OpenFF 生态。
上手提示
用于关键决策点的少量分子精算,而非海量初筛;需要可靠结合姿势与参数化作前提。