OpenFold 是 AlphaFold2 的开源、可训练 PyTorch 复现,支持从头训练与微调。
安装与部署
按官方仓库配置环境与数据库(MSA 数据库较大),需 GPU。
典型用法
- 推理预测蛋白结构
- 在自有数据上微调模型
- 研究与改进 AF2 架构
- 把结构预测嵌入自有管线
上手提示
只想拿结果用 ColabFold(118)更省事;要定制/微调才上 OpenFold。MSA 数据库与算力是主要成本。
延伸资源
- 论文见 112;对照 118《ColabFold》。
OpenFold 是可训练的开源 AlphaFold2 复现,适合需要微调或扩展结构预测模型的团队。
OpenFold 是 AlphaFold2 的开源、可训练 PyTorch 复现,支持从头训练与微调。
按官方仓库配置环境与数据库(MSA 数据库较大),需 GPU。
上手提示
只想拿结果用 ColabFold(118)更省事;要定制/微调才上 OpenFold。MSA 数据库与算力是主要成本。