RFdiffusion 用扩散模型从头生成蛋白骨架,支持 binder、motif 支架、对称等条件设计。
安装与部署
按官方仓库配置环境,需 GPU。
典型用法
- 生成满足约束的蛋白骨架
- 做靶向结合物(binder)设计
- motif 支架与对称组装
- 配合 ProteinMPNN 设计序列
上手提示
设计流程:RFdiffusion 生成骨架 → ProteinMPNN 设计序列 → AF2 过滤验证;生成需大量采样与筛选。
延伸资源
- 论文见 151;配套 196。
RFdiffusion 用扩散模型按约束生成蛋白骨架,可做结合物设计与对称组装,是蛋白从头设计的主力。
RFdiffusion 用扩散模型从头生成蛋白骨架,支持 binder、motif 支架、对称等条件设计。
按官方仓库配置环境,需 GPU。
上手提示
设计流程:RFdiffusion 生成骨架 → ProteinMPNN 设计序列 → AF2 过滤验证;生成需大量采样与筛选。