Perses 是基于 OpenMM 的炼金自由能计算工具，支持相对结合自由能等。
安装与部署
按官方文档用 conda 安装；需 GPU 与较强算力。
典型用法
- 搭建炼金自由能（RBFE）计算
- 研究自由能方法与协议
- 与 OpenFF/OpenMM 生态结合
- 做自定义的自由能工作流
上手提示
偏研究/方法定制；要开箱即用的标准 RBFE 流程，OpenFE（201）更友好。
延伸资源
- 概念见 127《FEP/RBFE/ABFE》；平台见 201。
Perses：炼金自由能计算工具介绍
Perses 基于 OpenMM 做炼金自由能计算（如 RBFE），适合研究与定制自由能方法。