ProteinMPNN 解决逆折叠：给骨架结构设计能折叠成它的序列，是蛋白设计核心工具。
安装与部署
按官方仓库部署（轻量，CPU 也可跑小任务）。
典型用法
- 给定骨架生成候选序列
- 为 RFdiffusion 生成的骨架设计序列
- 处理单体/复合物/对称体系
- 配合结构预测验证设计
上手提示
常与 RFdiffusion（197）组成「生成骨架 + 设计序列」管线；设计后用 AF2/ESMFold 验证可折叠性。
延伸资源
- 论文见 150；配套 197。
ProteinMPNN：蛋白序列设计工具实战
ProteinMPNN 给定骨架结构设计氨基酸序列，实验成功率高，是蛋白设计管线的核心工具。