PubChem(NCBI)是全球最大的免费化学信息数据库,包含化合物(Compound)、物质(Substance)与生物测定(BioAssay)三大库。
有什么数据
- 上亿化合物的结构与性质
- 生物测定(BioAssay)活性数据
- 专利、文献与交叉引用
- 化合物标识与同义词
怎么获取与使用
网页检索单个化合物,或用 PUG-REST / PUG-View API、批量下载服务获取大规模数据;可按结构、性质、活性等检索。
使用提示
数据来源广、质量参差,使用前需甄别来源与实验类型;活性数据常用于构建 HTS 类 Benchmark(如 LIT-PCBA,见 242)。
延伸资源
- 对照 226《ChEMBL》;Benchmark 见 242。