DepMap(Cancer Dependency Map)用全基因组 CRISPR/RNAi 敲除筛选,量化各癌细胞系对每个基因的依赖性。
有什么数据
- 基因敲除的细胞活力效应(依赖性分数)
- 数百癌细胞系覆盖
- 与组学/突变的关联
- 选择性依赖的发现
怎么获取与使用
网页交互查询或下载数据;用于找「某类癌细胞特别依赖、正常细胞不依赖」的选择性靶点。
使用提示
选择性依赖(在突变背景下的合成致死)是优质靶点线索;结合 CCLE(265)组学解释依赖来源。
延伸资源
- 对照 265《CCLE》、266《GDSC》。