DUD-E(Directory of Useful Decoys, Enhanced)为一批靶点提供活性分子与性质匹配的诱饵(decoy),用于评测虚拟筛选/对接的富集能力。
有什么数据
- 多个靶点的已知活性分子
- 物理性质匹配的诱饵分子
- 用于计算富集(EF、AUC)
- 覆盖多类靶点
怎么获取与使用
下载对应靶点的活性与诱饵,跑虚拟筛选后算富集指标评估方法。
使用提示
DUD-E 有已知偏倚:诱饵与活性在某些隐性特征上可分,深度学习易「作弊」学到与结合无关的差异。结论要谨慎,配合更真实基准(见 242)。
延伸资源
- 对照 242《LIT-PCBA》;陷阱见 169。