MSigDB(Molecular Signatures Database)提供大量精选基因集(通路、特征签名等),是 GSEA 分析的标准来源。
有什么数据
- Hallmark、通路、调控等基因集
- 疾病/扰动相关签名
- 与 GSEA 配套使用
- 多物种映射
怎么获取与使用
下载基因集配合 GSEA/ssGSEA 分析表达数据;用于推断通路活性与药物机制。
使用提示
基因集分析比单基因更稳健;选合适的基因集合集(如 Hallmark)做解读,避免过度挑选。
延伸资源
- 对照 262《Gene Ontology》、268《LINCS L1000》。