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MSigDB:基因集分析与药物机制研究

MSigDB 提供大量精选基因集,配合 GSEA 用于解读表达变化、推断药物机制与通路活性。

MSigDB(Molecular Signatures Database)提供大量精选基因集(通路、特征签名等),是 GSEA 分析的标准来源。

有什么数据

  • Hallmark、通路、调控等基因集
  • 疾病/扰动相关签名
  • 与 GSEA 配套使用
  • 多物种映射

怎么获取与使用

下载基因集配合 GSEA/ssGSEA 分析表达数据;用于推断通路活性与药物机制。

使用提示

基因集分析比单基因更稳健;选合适的基因集合集(如 Hallmark)做解读,避免过度挑选。

延伸资源

  • 对照 262《Gene Ontology》、268《LINCS L1000》。