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STRING:蛋白互作网络如何用于靶点分析

STRING 提供已知与预测的蛋白-蛋白互作网络,帮助把靶点放进相互作用与通路的语境中分析。

STRING 是蛋白-蛋白相互作用(PPI)数据库,整合实验、数据库、共表达、文本挖掘与预测的互作证据。

有什么数据

  • 蛋白-蛋白互作网络及置信分
  • 多类证据(实验/预测/文本等)
  • 功能富集分析
  • 可视化的互作网络

怎么获取与使用

网页输入蛋白/基因生成网络,或用 API 批量;用于把靶点放进互作网络语境、找相关蛋白。

使用提示

互作证据含预测与文本挖掘,置信分有高低,需按证据类型甄别;用于假设生成而非定论。

延伸资源

  • 对照 259《BioGRID》、260《Reactome》。