CCLE（Cancer Cell Line Encyclopedia）提供数百癌细胞系的表达、突变、拷贝数等多组学数据。
有什么数据
- 细胞系的表达/突变/拷贝数等组学
- 与 DepMap 依赖性匹配的细胞系
- 蛋白/代谢等扩展数据
- 癌型与谱系注释
怎么获取与使用
通过 DepMap 门户下载；常与 DepMap 依赖性、GDSC 药敏联合分析。
使用提示
是解释「为什么某细胞系依赖某基因/对某药敏感」的组学基础；细胞系模型与真实肿瘤有差距。
延伸资源
- 对照 264《DepMap》、266《GDSC》。