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cBioPortal:肿瘤基因组数据查询指南

cBioPortal 提供友好的界面查询大量癌症基因组数据集,便于快速探索基因突变、表达与临床关联。

cBioPortal 是癌症基因组学的可视化查询平台,整合 TCGA 等大量公开肿瘤数据集。

有什么数据

  • 基因突变/拷贝数/表达查询
  • 跨数据集的基因/通路分析
  • 与临床数据的关联
  • 可视化(OncoPrint、生存曲线等)

怎么获取与使用

网页交互查询基因/通路在各癌种的改变,或用 API 批量;适合快速做靶点的肿瘤基因组学调研。

使用提示

是探索 TCGA 等数据的便捷入口;用于假设生成,统计关联需谨慎解释。

延伸资源

  • 对照 270《TCGA》、264《DepMap》。