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CrossDocked2020:深度学习 Docking 常用数据集

CrossDocked2020 提供大量交叉对接的姿势,是训练深度学习对接与结构based生成模型的常用数据集。

CrossDocked2020 把 PDB 中同源口袋的配体相互「交叉对接」,生成大量姿势,是深度学习对接与生成的常用数据集。

有什么数据

  • 大量交叉对接的蛋白-配体姿势
  • 按口袋聚类的结构
  • 正确/错误姿势的标注
  • 适合训练打分与生成模型

怎么获取与使用

下载数据集用于训练;常见于结构based分子生成(如基于口袋生成分子)与对接打分研究。

使用提示

交叉对接姿势包含大量非天然构象,适合训练「区分好坏姿势」;注意按口袋聚类划分以避免泄漏。

延伸资源

  • 对照 238《PDBbind》;生成见「新药模态」「AI 模型」模块。