RCSB PDB 是 PDB 在美国的主门户,提供高级检索、批量下载与丰富的结构质量信息。
有什么数据
- 按序列/配体/方法/分辨率等高级检索
- 结构质量指标(分辨率、R-free、验证报告)
- 配体结合位点与相互作用信息
- 批量下载与 API
怎么获取与使用
网页高级检索定位结构,下载 PDB/mmCIF;用结构验证报告判断质量后再用于对接/建模。
使用提示
选结构看三点:分辨率(越低越好,如 <2.5 Å)、R-free、目标口袋区域电子密度是否清晰;有共晶配体的结构更适合做对接验证。
延伸资源
- 对照 236《PDB》;修复见 215《PDBFixer》。