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UniProt:蛋白信息检索的基础数据库

UniProt 是蛋白序列与功能注释的权威基础库,几乎所有蛋白相关分析都从它取序列与注释。

UniProt 是蛋白序列与功能注释的权威数据库(含人工审编的 Swiss-Prot 与自动的 TrEMBL)。

有什么数据

  • 蛋白序列与同工型
  • 功能、结构域与位点注释
  • 亚细胞定位与翻译后修饰
  • 与 PDB/Pfam/InterPro 等交叉引用

怎么获取与使用

网页检索单个蛋白,或用 API/下载做批量;是结构预测、序列建模、注释的基础数据源。

使用提示

优先用 Swiss-Prot(人工审编)条目;序列同工型与规范序列的选择会影响下游分析。

延伸资源

  • 对照 256《Pfam》、257《InterPro》;序列模型见 194《ESM》。