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TCGA:癌症多组学数据在靶点发现中的用途

TCGA 提供数十种癌症的大规模多组学与临床数据,是癌症靶点发现与生物标志物研究的基石数据集。

TCGA(The Cancer Genome Atlas)对数十种癌症的数千样本做了基因组、转录组、表观与临床的多组学刻画。

有什么数据

  • 突变/拷贝数/表达/甲基化等多组学
  • 配套临床与生存信息
  • 数十种癌型、数千样本
  • 靶点与生物标志物发现的基础

怎么获取与使用

通过 GDC、cBioPortal(269)等门户访问;用于关联分子改变与临床结局、发现候选靶点。

使用提示

样本量大、维度全,是癌症靶点研究基石;注意批次效应与多重检验,关联≠因果。

延伸资源

  • 对照 269《cBioPortal》、249《Open Targets》。