TCGA(The Cancer Genome Atlas)对数十种癌症的数千样本做了基因组、转录组、表观与临床的多组学刻画。
有什么数据
- 突变/拷贝数/表达/甲基化等多组学
- 配套临床与生存信息
- 数十种癌型、数千样本
- 靶点与生物标志物发现的基础
怎么获取与使用
通过 GDC、cBioPortal(269)等门户访问;用于关联分子改变与临床结局、发现候选靶点。
使用提示
样本量大、维度全,是癌症靶点研究基石;注意批次效应与多重检验,关联≠因果。
延伸资源
- 对照 269《cBioPortal》、249《Open Targets》。