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LIT-PCBA:更接近真实筛选场景的 Benchmark

LIT-PCBA 从真实高通量筛选实验构建,活性/非活性更真实、更不平衡,弥补 DUD-E 的偏倚问题。

LIT-PCBA 从 PubChem 的真实高通量筛选(HTS)实验中构建,活性与非活性都来自实验确认,更贴近真实筛选场景。

有什么数据

  • 实验确认的活性与非活性分子
  • 高度不平衡(贴近真实命中率)
  • 多个靶点的筛选任务
  • 用于评估真实富集能力

怎么获取与使用

下载数据集做虚拟筛选评测;适合检验方法在「真实、不平衡」场景下的表现。

使用提示

相比 DUD-E 更难也更真实;不平衡数据要用合适指标(如 EF、BEDROC)评估,别用准确率。

延伸资源

  • 对照 241《DUD-E》;指标见 155。