Pfam 用 HMM 概型定义蛋白家族与结构域,现已整合进 InterPro。
有什么数据
- 蛋白家族与结构域定义(HMM)
- 结构域的序列与功能注释
- 蛋白的域组成
- 家族层级与关系
怎么获取与使用
通过 InterPro 门户查询,或用 HMMER 对序列做域注释;识别蛋白由哪些功能模块组成。
使用提示
结构域视角有助于理解功能与可成药性(如激酶域、GPCR);Pfam 现作为 InterPro 的成员库使用。
延伸资源
- 对照 257《InterPro》、255《UniProt》。
Pfam 用隐马尔可夫模型定义蛋白家族与结构域,帮助识别蛋白的功能模块。
Pfam 用 HMM 概型定义蛋白家族与结构域,现已整合进 InterPro。
通过 InterPro 门户查询,或用 HMMER 对序列做域注释;识别蛋白由哪些功能模块组成。
使用提示
结构域视角有助于理解功能与可成药性(如激酶域、GPCR);Pfam 现作为 InterPro 的成员库使用。