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Pfam:蛋白结构域数据库怎么用

Pfam 用隐马尔可夫模型定义蛋白家族与结构域,帮助识别蛋白的功能模块。

Pfam 用 HMM 概型定义蛋白家族与结构域,现已整合进 InterPro。

有什么数据

  • 蛋白家族与结构域定义(HMM)
  • 结构域的序列与功能注释
  • 蛋白的域组成
  • 家族层级与关系

怎么获取与使用

通过 InterPro 门户查询,或用 HMMER 对序列做域注释;识别蛋白由哪些功能模块组成。

使用提示

结构域视角有助于理解功能与可成药性(如激酶域、GPCR);Pfam 现作为 InterPro 的成员库使用。

延伸资源

  • 对照 257《InterPro》、255《UniProt》。