抗体识别抗原靠 6 个 CDR 环，其中 CDR-H3 最难建模，也最关键。
为什么 H3 难
- 长度与序列高度多变
- 缺乏可靠模板
- 构象灵活、可诱导契合
- 决定抗原特异性
建模思路
- 抗体专用模型针对 CDR 优化
- 采样多个 loop 构象
- 结合抗原做诱导契合
- 用实验数据校正
关键要点
抗体建模的成败几乎取决于 CDR-H3；这也是抗体专用模型存在的根本原因。
延伸资源
- 对照 364《抗体结构预测》、366《亲和力成熟》。
CDR Loop 建模：抗体可变区为什么最难预测
CDR 环（特别是 CDR-H3）长度多变、缺乏模板、构象灵活，是抗体结构预测里最难的部分，直接决定抗原识别。