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de novo 蛋白结合物设计：RFdiffusion 走进生物药

用 RFdiffusion 生成结合物骨架、ProteinMPNN 设计序列，可从头设计结合指定靶点的蛋白，把 AI 蛋白设计带入生物药。

de novo 结合物设计不再从天然抗体出发，而是用 AI 从零设计能结合指定靶点的蛋白。

技术管线

  • RFdiffusion 按靶点生成结合物骨架（见 151）
  • ProteinMPNN 设计可折叠序列（见 150）
  • AF2/ESMFold 过滤验证可折叠性
  • 实验表达与结合验证

意义与现状

  • 可针对指定表位「定制」结合物
  • 绕开天然抗体的限制
  • 成功率在提升但仍需大量筛选
  • 是 AI 蛋白设计最前沿的应用之一

关键要点

de novo 结合物把蛋白设计从「改造天然」推进到「从零创造」；是生物药 AI 的标志性方向。

延伸资源

  • 对照 151《RFdiffusion》、150《ProteinMPNN》。