MODULE 10 / 28 RECORDS
新药模态
TPD、抗体/生物药、多肽、核酸、共价/PPI
- 356 PROTAC 是什么：双功能分子如何招募 E3 连接酶降解靶点 PROTAC 用双功能分子招募 E3 连接酶降解靶蛋白。这篇讲清作用机制、与抑制剂的本质差别，以及事件驱动药理学的含义。 →
- 357 分子胶 Molecular Glue：从偶然发现到理性设计 分子胶通过诱导蛋白间新的相互作用界面发挥作用。这篇讲清它与 PROTAC 的差别、经典案例与理性设计的困难。 →
- 358 E3 连接酶选择：为什么 CRBN 和 VHL 最常用 CRBN 与 VHL 是降解剂开发中最常用的两个 E3 连接酶。这篇讲清选择依据、两者的差别，以及拓展 E3 工具箱的意义。 →
- 359 三元复合物 Ternary Complex：降解剂为什么比抑制剂更难设计 三元复合物的形成是降解剂成败的核心，也是它比抑制剂难设计的根本原因。这篇讲清协同性、界面互补与计算建模的现状。 →
- 360 PROTAC Linker 设计：连接子如何影响降解效率 PROTAC 连接子的微小改变可能让降解效率相差百倍。这篇讲清连接子的三个设计维度、经验规律与优化策略。 →
- 361 AI 预测降解活性：从结构到 DC50 和 Dmax AI 想从结构预测降解活性，但三元复合物机制复杂、数据稀缺，目前仍是开放难题。这篇讲清难点、现有做法与合理预期。 →
- 362 降解剂成药性：突破 Ro5 之外的口服与通透性挑战 降解剂分子量远超 Ro5，口服与通透性是主要挑战。这篇讲清 bRo5 空间的性质规律、分子伞效应与实际优化手段。 →
- 363 分子胶发现：数据库挖掘与 AI 筛选策略 分子胶难以理性设计，发现主要靠数据挖掘与筛选。这篇给出可操作的挖掘策略、筛选设计与验证流程。 →
- 364 抗体结构预测：通用模型与抗体专用模型的差异 抗体结构预测有通用模型与抗体专用模型两条路线。这篇讲清两者的差异、各自的适用场景与精度水平。 →
- 365 CDR Loop 建模：抗体可变区为什么最难预测 CDR-H3 是抗体结构预测中最难的部分。这篇讲清难在哪、典型构象的概念，以及处理 H3 不确定性的实际策略。 →
- 366 抗体亲和力成熟：AI 如何加速突变筛选 抗体亲和力成熟可以用 AI 加速突变筛选。这篇给出零样本打分、深度突变扫描建模与实验设计的完整方法。 →
- 367 抗体可开发性 Developability：聚集、黏度与稳定性预测 抗体可开发性决定能否从实验室走到生产。这篇给出聚集、黏度、稳定性的预测方法与实用的筛选指标。 →
- 368 免疫原性预测：T 细胞表位识别与去免疫化 免疫原性会让生物药失效。这篇讲清 T 细胞表位的机制、预测方法与去免疫化的实际策略。 →
- 369 纳米抗体与单域抗体：小型生物药的设计要点 纳米抗体与单域抗体是小型生物药的重要形式。这篇讲清它们的结构特点、优势场景与设计要点。 →
- 370 de novo 蛋白结合物设计：RFdiffusion 走进生物药 RFdiffusion 让从头设计蛋白结合物成为可操作的流程。这篇给出完整管线、计算过滤判据与实验成功率的现实预期。 →
- 371 抗体-抗原对接与表位预测 抗体-抗原对接与表位预测是理解结合机制的基础。这篇给出方法选择、复合物预测的用法与表位映射的实验对照。 →
- 372 多肽药物设计：可成药空间与稳定性挑战 多肽药物介于小分子与生物药之间，可成药空间与稳定性是核心挑战。这篇讲清设计要点、稳定化策略与计算方法。 →
- 373 大环化合物 Macrocycle：跨越类药规则的分子设计 大环化合物跨越了常规类药规则的边界。这篇讲清大环的构象特点、通透性机制与计算处理的特殊要求。 →
- 374 多肽通透性与口服化：从结构到递送 多肽的通透性与口服化是最大的工程挑战。这篇讲清被动扩散的障碍、结构改造手段与递送技术路线。 →
- 375 反义寡核苷酸 ASO：序列设计与化学修饰 反义寡核苷酸通过碱基配对靶向 RNA。这篇讲清作用机制、化学修饰的作用、序列设计要点与脱靶控制。 →
- 376 siRNA 设计：靶向选择与脱靶预测 siRNA 通过 RNAi 通路降解目标 mRNA。这篇讲清设计规则、脱靶预测与化学修饰的作用。 →
- 377 mRNA 序列优化：密码子、二级结构与稳定性 mRNA 序列优化涉及密码子、二级结构与修饰核苷酸。这篇讲清各个优化维度的作用与权衡。 →
- 378 LNP 递送系统：核酸药物绕不开的瓶颈 LNP 是核酸药物绕不开的递送瓶颈。这篇讲清 LNP 的组成、内体逃逸的核心难题与肝外递送的现状。 →
- 379 共价抑制剂设计：弹头选择与可逆性权衡 共价抑制剂通过化学键与靶点结合。这篇讲清弹头选择、可逆性权衡、选择性控制与设计要点。 →
- 380 共价对接 Covalent Docking：如何建模反应性结合 共价对接需要同时建模非共价识别与化学反应。这篇给出工具选择、参数设置与结果解读的实际方法。 →
- 381 变构位点发现 Allosteric Site：超越正构口袋 变构位点提供了正构口袋之外的调控机会。这篇讲清变构调节的价值、位点发现方法与设计上的特殊挑战。 →
- 382 PPI 抑制剂：蛋白互作界面为什么难成药 PPI 界面难成药，但已有成功案例。这篇讲清界面的特点、热点残基概念与各类模态的适用性。 →
- 383 分子设计中的多模态趋势：小分子之外的统一表征 小分子之外的模态需要统一的表征方式。这篇讲清多模态建模的现状、跨模态迁移的可能性与现实困难。 →